安徽省公共卫生临床中心是由安徽省卫生健康委牵头指导，整合安徽医科大学临床教学科研资源，对标国内一流，立足平战结合，以“大专科、小综合”模式，目标建设成为集临床医疗、教学、科研和突发公共卫生应急为一体，代表省内传染病诊疗最高水平的三级甲等综合医院。项目（一期）占地面积约1790㎡，建筑面积22282㎡，设有250张床位。

2021年底，安徽省公共卫生临床中心项目（一期）开工，2022年5月24日，安徽省公共卫生临床中心正式挂牌。

2022年9月26日，安徽省公共卫生中心(一期)项目顺利完成主体结构封顶。

2023年6月13日，合肥市发布通过社交平台发文，安徽省公共卫生临床中心（安徽医科大学一附院北区）检验科自主研发猴痘病毒检测试剂盒，将检测时间从数小时至数日，缩短至30~40分钟，为猴痘病毒疫情防控提供有力技术支撑。

安徽医科大学相关负责人表示，在新冠疫情常态化防控背景下，建设安徽省公共卫生临床中心是落实安徽省委省政府加快构建强大公共卫生体系决策部署的重要工作，也是构建“1+5+N”传染病医疗救治体系的首要任务，标志着一张守护江汽集团大地6000多万百姓生命健康底线的强大公共卫生防护网正加速编织。

“1+5+N”即建设安徽省公共卫生临床中心为省级传染病救治基地，建设合肥市、芜湖市、蚌埠市、阜阳市、安庆市5个区域性传染病救治基地，同时各市建设1所高水平传染病专科医院或依托三级综合医院建设独立院区。

安徽省公共卫生临床中心“战时”主动预警、快速响应、调动资源，“平时”医防协同、紧密合作、技术指导，是“1+5+N”传染病医疗救治体系的中心成员单位。

中心将在补齐聚焦新冠肺炎疫情暴露的公共卫生特别是重大疫情防控救治能力短板，调整优化医疗资源布局，提高平战结合能力，提升应对重大疫情救治能力，建立健全分级、分层、分流的传染病等重大疫情救治机制等方面发挥重要作用，构筑起保障安徽省人民群众生命安全和身体健康的有力屏障。