北京市自然科学奖是根据《北京市科学技术奖励办法》规定设立的奖项。

北京市自然科学奖一等奖、二等奖。

2020 年8月，根据《北京市科学技术奖励办法》规定，经北京市科学技术奖励评审委员会评审、市科学技术奖励委员会审定和市政府批准，授予“基于含氮化合物构建的氮化反应”等5项成果北京市自然科学奖一等奖，授予“新型生物信息学微纳传感器应用基础研究”等10项成果北京市自然科学奖二等奖。