新洲码头是
广州水上巴士航线的重要组成部分。该航线共设有12条路线，覆盖了25个码头，运营着38艘船只。整个系统的总里程达到46.8公里，构成了
广州市公共交通体系的一部分，旨在减轻陆地交通的压力并提供便捷的出行选择。
S5线路是新洲码头所连接的一条重要水上巴士路线。该线路上的第一段起点为
鱼珠站，途经军校站后到达新洲码头。而第二段则保持原有的路线，继续由新洲码头前往深井站。具体运行时间为：第一段从早上7:15开始至晚上19:45结束；第二段则从凌晨5:45起航直至深夜22:00收工。此外，不同路段之间的发车间隔也有所不同，其中鱼珠至深井的班次间隔为每小时一班，而新洲至深井的班次则更为频繁，每隔半小时就会有一趟船出发。