明朝洪武元年(1368年)将温州路改设为温州府,隶属于浙江行省。洪武二年(1369年),瑞安州降为
瑞安市。
洪武九年(1376年),浙江行省改为浙江布政使司,温州府隶属于该司。
景泰三年(1452年),从瑞安县和
平阳县的部分地区析置
泰顺县。
成化五年(1469年),从
乐清市和台州府黄岩县的部分地区析置
温岭市,归属台州府。明朝末期,温州府共辖五县。
清朝继续使用温州府这一
行政区划。
雍正六年(1728年),从乐清县和台州府太平县的部分地区设置玉环厅,直属
温处道,不隶属温州府。此时,温州府辖区包括
永嘉县、乐清县、
瑞安市、泰顺县和平阳县。