水库原设计洪水位32米高程，校核洪水32.35米，正常高水位31.50米，汛限水位30米高程，死水位23米高程。总库量1310万立方米，其中防洪库容171万立方米。兴利库底1033万立方米，死库容106万立方米。坝顶高程33.31米，最大坝高23.31米，坝顶长度846米，坝顶宽度5米，主坝坝型为心墙多种土质坝。1979年12月保坝竣工后，坝顶高程为34.50米，最大坝高24米，坝顶长度910米，坝顶宽度4.5米。副坝长度200米，最大坝高3.7米。溢洪道为宽顶堰，堰顶高程31.5米，堰顶净宽10米，最大泄流量74秒立方米。输水涵洞是有压圆管斜拉式，直径1米，进口高程23米，闸门型式转动门盖，最大泄量5秒立方米。洞出口分出南北干渠2条，南干渠长5.71公里，北干渠长3.85公里，总长18.56公里，其中利用溪流入沿江渠9公里。支渠17条，总长15.4公里。南北干渠设新垵、洋尾抽水机站2处，计75匹马力。渠道沿线各种建筑物125座，灌溉晋江、南安2县的
磁灶镇、青阳、
内坑镇、
官桥4个(乡)镇、13个大队、109个生产队。
淹没耕地2479.81亩，其中晋江县新垵大队1026.24亩，南安县岭兜大队1453.57亩。迁移人口1041人。原设计有效灌溉面积1.21万亩，保灌1.21万亩，核定后有效灌溉面积1.74万亩，保灌1.21万亩，实灌1.3万亩，保灌1.3万亩，保证率P＝90%为7580亩。库区可绿化12004亩，可养水面2249亩。水库涉及下游
磁灶镇，人口7万人，耕地8万亩和
福厦公路。
1963年，水库管理处开展综合经营，利用输水涵洞出口落差建25匹马力饲料
加工厂，种植水稻、
番薯17.6亩，饲养耕牛、猪、鸡、鸭、羊、兔82只，当年总收入1645.61元。1964年6月14日，库区日雨量达103.9毫米，最高洪水位28.32米高程，发现当库水位升在28米高程以上，坝左端与原山坡连接地段有渗漏，经保坝加固时在背水坡加厚处理后，现已不再渗漏。1967年大坝发现蚁害，当年曾用人工挖找蚁路和蚁穴，然后补填上土，至1982年未对蚁穴再处理。是年发现输水涵洞基础沉陷不均，产生条石断裂3处漏水，分别在距进水口8.3米、16.75米、21.7米处，当库水位在27.72米高程时，实测漏水量分别为14.7升/分、2.5升/分、2.5升/分。1979年冬采用
ep堵塞裂缝，效果尚好。
“文化大革命”期间，水库管理机构瘫痪，大坝迎水坡被拆去30平方米，坝区山林被砍光，大坝反滤层被某些社员开垦9亩作为自由地，渠道上放水涵破坏63座，排洪闸被毁23座，灌溉面积减少3000亩。 1976年后，水库管理工作恢复。1978年对工程进行全面整修配套。完成通讯线路2条11公里，防汛公路2条3.5公里，至1980年完成石渠化40.5公里。 1977年2月底，经
福建省水利电力局核定，新垵水库保坝工程列为1978年农田水利基本建设项目，并经晋江县县委研究，由晋江县水利电力局进行保坝设计。保坝设计重现期为100年一遇，3天雨量H24＝354毫米(H24，为24小时降雨深度)，洪峰流量Q24＝191秒立方米(Q24，为24小时洪峰流量)，3天洪水总量W24＝395万立方米(W24，为24小时总的来水量)。校核重现期为1万年一遇，3天雨量1000毫米，洪峰流量488秒立方米，3天洪水总量1140万立方米。保坝后，校核洪水位34.39米，设计洪水位32.65米。1979年12月经
福建省水利电力厅审批保坝加固防洪标准以500年一遇设计，以1000年一遇校核，现已达到中型水库的防洪规定标准。