《胃肠病学》创刊于1996年，1999年起正式对国内外公开发行，由国家教育部主管，
上海交通大学医学院附属仁济医院主办，上海交通大学医学院附属仁济医院、
上海市消化疾病研究所编辑出版，
萧树东教授任主编。设有有述评、点评、特约文稿、学术争鸣、论著、共识与指南、短篇论著、会议纪要、综述、讲座、国外文献阅读、病例分析与个案报道等栏目。
《胃肠病学》 是为消化病学领域内的研究成果、临床经验、新观点和各种假说的交流与沟通提供园地。为此，该刊特邀一批国内外著名胃肠病学专家担任编委和顾问，具有较高的学术水准。作为消化专业综合性刊物的 《胃肠病学》，将及时传递国内外最新学术信息，登载优秀的研究论著、文献综述和述评，对不同的学术观点兼收并蓄，突出科学性、严肃性，使本刊成为一本科学性强、形式多样和学术气氛活跃的刊物。
《胃肠病学》是
荷兰医学文摘（EMBASE）数据库收录期刊，是国家科技部中国科技论文统计源期刊，中国科技核心期刊。