国家农业机械工程技术研究中心于1999年经国家科学技术部批准正式开始组建，2003年3月获得正式命名，是中国农机院和广东省农业机械研究所共同建设的技术研发机构。

国家农业机械工程技术研究中心的主要依托单位是中国农业机械化科学研究院，同时为了更好地服务于华南地区，还设立了以广东省农业机械研究所为依托的南方分中心。

该中心主要致力于研究和发展农业机械化战略，以及相关的技术装备，包括但不限于收获、耕作种植与植保、节水灌溉、农副产品加工、畜牧饲养、粮食仓储等领域。其工作不仅限于技术研发，还包括这些技术的工程转化和产业化推广，旨在推动整个行业的进步与发展。

国家农业机械工程技术研究中心在2002年11月的验收中获得了5A的优异成绩，这表明了该中心在科研和技术成果转化方面的卓越成就。