新疆马鹿是马鹿种群分布在新疆所有亚种的通称，包括3个亚种(塔里木亚种C.e.yarkandensis、天山亚种C.e.songaricus和阿勒泰市亚种C.e.长尾朱雀)，新疆马鹿的野外种群已经基本在本世纪初绝灭。

新疆马鹿主要分布在昭苏县、特克斯县和察布查尔锡伯自治县。也产于哈密市伊吾、巴里坤草原和木垒哈萨克自治县等地，俗称“黄眼鹿”。

新疆马鹿分为北疆亚种、东疆亚种和塔里木盆地亚种

成年公鹿体高130-140厘米，长 130-150厘米，体重240-330千克；母鹿体高115-130厘米，体长120-140厘米，体重160-200千克。体粗壮，头大额宽，四肢强健。夏毛呈深灰色，臀斑呈棱状，白色或浅黄色。冬毛呈灰褐色，颈部有长而粗密的毛和毛，头、颈和四肢的毛呈深灰色，眼圈呈浅黄色。茸毛呈灰黑色或灰白色。

马鹿16~18月龄性成熟，一般公鹿4岁、母鹿3岁可以配种，配种方式多为公母混群，自然配种。受胎率可达90%以上，妊娠期225~245天。一般一胎一仔，偶然也有产双胎的。