新和硕特旗是清代的一个旗名，该旗历史上曾直辖于科布多参赞大臣，并在不同时期隶属于不同的行政区划。1921年，新和硕特旗的地域被划入蒙古国。

新和硕特汗国旗的成立源于乾隆三十七年（1772年），当时和硕特台吉巴雅尔拉湖族人蒙衮归附清朝，并被授予一等台吉的头衔。乾隆五十七年（1792年），和硕特人因不满沙喇扣肯的统治，迁往哈密察克地区游牧。爱新觉罗·颙琰元年（1796年），新和硕特旗获得札萨克印章，成为独立的旗，不领俸禄，不设盟，直接由科布多参赞大臣管辖，并统属于乌里雅苏台定边左副将军。