复旦大学数学研究所(Institute of 数学,Fudan University)经国家教育部批准，于1956年中国科学院在复旦大学成立数学研究室，由学部委员苏步青教授任室主任。1958年成立中国科学院上海数学研究所，由复旦大学和中国科学院共同领导。1962年调整后该所完全归属复旦大学，并改名为复旦大学数学研究所。

历任所长：苏步青(1956-1986年)、谷超豪(1986年始)、洪家兴。该所的创办宗旨是：为国家培养高级数学人才和承担国家重点科研项目(现代数学的理论和方法)的科研任务。该所在1964年增加了专职编制，开始设立微分几何、函数论与泛函分析、微分方程、概率论与数理统计等4个研究室。“文化大革命”中被迫解散。粉碎“四人帮”后，在党和国家的亲切关怀下，在所长苏步青教授领导下迅速地恢复了微分几何、泛函分析(包括函数论)、微分方程(常微和偏微)、概率论与数理统计、应用数学(计算数学、控制论、运筹学)等5个研究室。1978年春季在全国率先恢复招收研究生，现在该所已建立了博士后流动站。1980年起，受国家教委的委托，负责创办了《数学年刊》，1983年起又分A、B两辑出版，其中A辑为中文版，B辑为英文版。B辑已被列为美国科学引文索引(SCI)世界核心期刊中纯粹数学期刊，A辑也由美国阿伦顿出版公司翻译为英文在美国发行。