假菌根的组成器官分为子实体和菌丝体两部分。菌丝体是有许多分枝状的菌丝互相交织形成的密集的群体，呈蛛网状。

成熟的双孢菇个体像一把撑开的小伞，它的组成器官分为子实体和菌丝体两部分。菌丝体是有许多分枝状的菌丝互相交织形成的密集的群体，呈蛛网状。菌丝又可分为绒毛菌丝、线状菌丝和索状菌丝。在制种和培养料发菌过程中希望其绒毛状菌丝生长旺盛，积累更多养分；出菇阶段则要求形成线状菌丝，才能结成子实体。越冬后，大部分绒毛状菌丝、线状菌丝已萎缩，而保留在土层中的索状菌丝多，通过春菇调水后，能萌发成绒毛菌丝再发育成线状菌丝，利于长菇，故要保护好，防止干掉或受冻。

子实体由菌丝进一步分化发育而成，分菌盖、菌褶、菌柄、菌膜、菌环、假菌根等部分。假菌根是着生于菌柄基部和覆土及培养料相接部位的根状菌丝索。