司法鉴定科学研究院，成立于1951年，前身为1932年成立的司法行政部法医研究所。作为中华人民共和国司法部直属的司局级科研事业单位，司法鉴定科学研究院主要承担司法鉴定领域的基础研究、应用研究和高新技术研究，以及中国重大疑难案件的司法鉴定和技术指导。此外，研究院还负责司法鉴定高端人才的培养培训以及中原地区国内外学术交流。

司法鉴定科学研究院历经多次调整，1960年因故撤销，1983年经国家科委批准正式复建。2017年10月14日，经过中央机构编制委员会办公室批准，司法鉴定科学研究院更名为司法鉴定科学研究院，成为司法部直属的司局级科研事业单位。截至2018年10月，研究院共有208名职工。

1951年，组建“华东军政委员会司法部法医研究所”。

1953年，更名为“最高人民法院华东分院法医研究所”。

1955年，由司法部主管，更名为“司法部法医研究所”。

1955年，经司法部批准，增挂“司法部司法鉴定科学研究所”牌子。

1958年，更名为“公安部三局刑事技术研究所”。

1960年，因故撤销。

1979年，筹备复建“司法部司法鉴定科学技术研究所”。

1983年，经国家科委批准正式复建“司法部司法鉴定科学技术研究所”。

2000年，经司法部批准，增挂“司法部司法鉴定中心”牌子。

2001年，经司法部批准，成立“上海市道路交通事故处理办法鉴定中心”。

2003年，经司法部批准，成为“全国司法鉴定人继续教育基地”。

2009年，成为“上海市法医学重点实验室”。

2010年，成为“国家级司法鉴定机构”。

2012年，经国标委批准，建设“国家级司法鉴定服务业标准化试点”。

2014年，确定为“上海市司法鉴定专业技术服务平台”。

2017年，经中央编办批准，更名为司法鉴定科学研究院。

2020年，获2020年度中国标准创新贡献奖组织奖。

根据2021年2月研究院官网显示，司法鉴定科学研究院有职工224人，其中党员106人，专业技术人员占78%，高级专业技术人员占专业技术人员总数的60%；享受国务院特殊津贴10人。（名单不全）

享受国务院特殊津贴专家：沈敏、卓先义、吴何坚、向平、范利华、陈忆九、凌敬昆、杨旭、李莉。

全国“百千万人才工程”人选：沈敏。

根据2021年2月研究院官网显示，司法鉴定科学研究院有下属研究室8个。

院属研究室：法医病理学研究室、法医临床学研究室、司法精神病学研究室、法医毒物化学研究室、法医物证学研究室、刑事技术研究室、道路交通事故处理办法技术鉴定研究室、司法鉴定制度与法规研究室。

司法部重点实验室：司法鉴定重点实验室。

上海市法医学重点实验室：法医学重点实验室。

根据2021年2月研究院官网显示，司法鉴定科学研究院与美国、英国、德国、法国、日本、澳大利亚、荷兰、俄罗斯、韩国、乌兹别克斯坦、哈撒克斯坦、香港特别行政区、澳门、乌克兰、芬兰等国家和地区开展了广泛的交流，先后与马里兰大学、香港政府化验所、乌兹别克斯坦司法部苏雷曼诺蛙犯罪侦查中心、中央兰开夏大学、俄罗斯司法部司法鉴定中心、荷兰法庭科学研究所签署了合作协议。2007年作为中方牵头单位，组建了由15家机构（其中中国国内5家、国外10家）参加的“国际司法鉴定教育合作计划”。

根据2021年2月研究院官网显示，司法鉴定科学研究院长期承担国家科技部、国家中华人民共和国国家自然科学基金委员会、司法部和上海市科委的重点科技攻关项目，牵头主持了“十二五”国家科技支撑计划项目、“十三五”国家重点研发计划。

《中国司法鉴定》创刊于2000年，由中华人民共和国司法部主管、司法部司法鉴定科学技术研究所主办的学术理论期刊，是《中国知网》《中国学术期刊（光盘版）》、万方数据—数字化期刊群全文收录期刊，《中文科技期刊数据库》（维普网）全文收录期刊、中国科技核心期刊、中国人文社会科学核心期刊（扩展版）。

《法医学杂志》创刊于1985年7月，由中华人民共和国司法部主管、司法鉴定科学研究院主办，被美国生物医学文献数据库（Index Medicus/美国国家医学图书馆（PubMed））、美国《乌利希期刊指南》（Ulrich’s Periodicals Directory）、美国《化学文摘》（CA）、美国《史蒂芬斯数据库》（EBSCOhost）、荷兰医学文摘（EMBASE）、Elsevier公司二次文献数据库（Scopus）、WHO西太平洋区医学索引（WPRIM）、中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）、中国科学引文数据库（CSCD）、RCCSE中国核心学术期刊（A）、中国人文社会科学期刊评价报告（AMI）、全国报刊索引（核心期刊）、中文科技资料目录－医药卫生（核心期刊）、万方数据股份有限公司资源系统-中国数字化期刊群、中国核心期刊（遴选）数据库、中国期刊全文数据库、中国学术期刊（光盘版）、中国学术期刊综合评价数据库、中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）、中国生物医学期刊引文数据库（CMCI）、中文科技期刊数据库、中国生命科学文献数据库（CBA）、台湾中文电子期刊服务-在线全文数据库（CEPS）、中国高影响力医学期刊论文计量报告（第1版）、超星期刊域出版平台等数据库和统计源收录。

2009年，经人社部批准，设立博士后科研工作站。

根据2021年2月研究院官网显示，司法鉴定科学研究院作为全国司法鉴定人继续教育基地，研究院与复旦大学、苏州大学、华东政法大学、南方医科大学深圳医院、四川大学、温州医科大学、中国刑事警察学院联合培养司法鉴定硕士、博士研究生。

2002年，法医物证与法医毒化专业获上海市计量认证合格证书。

2004年，获国家检查机构认可和实验室认可证书，成为全国首家全面通过国家认可的司法鉴定机构。

2005年，经上海市司法局审核登记，成立“司法鉴定科学技术研究所司法鉴定中心”。

2006年，获国家能力验证计划提供者认可证书，取得实施行业能力验证活动的资质。

2009年，获国家级实验室/检查机构资质认定、国家实验室认可、检查机构认可、能力验证提供者认可证书。

2010年，经五部委遴选，成为“国家级司法鉴定机构”。

2019年，环境损害司法鉴定资质通过行政审批。

司法鉴定科学研究院标识为双外环及内中心圆形成的“S”型，内中心圆有研究院英文及其缩写。

科学研究是基础工作，司法鉴定是主要职能，教育培训是基本任务，技术指导是重要职能。