尼山书院位于尼山孔庙以北，又名尼山诞育书院。元至元二年（1336年），
中书左丞
王懋德奏请在
尼山创建书院，并保举彭为山长，获准。彭上任后不久，即修建尼山书院。现为全国重点文物保护单位。
元至元二年（1336年），中书左丞王德奏请在尼山创建书院，并保举彭为山长，获准。彭璠上任后不久，即修建尼山书院。《尼山创建书院碑》载，修建此书院时，“凡齐鲁之境贤卿大夫，民之好事者，出钱而助成之。释木于山，陶于野，庸致远，
牵牛车，服力役，连载途，饮饷相望。”元朝末年，尼山书院败落，至明永乐十五年（1417年）由五十九代衍圣公
孔彦缙发起重修，弘治七年（1494年）六十一代衍圣公
孔宏绪、四氏学学录孔公又用修建
孔子庙的余资再次修建。
今庙围垣缭绕，环植
松柏，共有院落五进，殿堂五十多间，正门名星门，二门名大成门。庙主体建筑为中间的大成殿，殿前有两庑各五间，殿之东、西各有掖门。过掖门，殿后有
寝殿三间，祀
孔子夫人木主，两庑各三间，祀孔子之子伯鱼及孙子思，但
塑像及木主今皆不存。东、西两侧门连接两旁跨院。东院前为讲堂，后为
土地祠，西院东侧连接
毓圣侯祠，且单成一院。西侧为启圣王殿和寝殿，系供奉孔子父母处。庙内外有元、明、清以及
中华民国的石碑约十余幢，是了解孔子出生地
尼山及其建筑群历史沿革的重要资料。
公元954-959年（
五代十国后周显德年间），因
孔子诞生于尼山而始建庙祀。公元1043年（
赵祯庆历三年）重修，建夫子殿，
寝殿，讲堂，学舍。公元1675年（清康熙十四年）重修，易土墙为石墙。公元1849年（
爱新觉罗·旻宁二十九年）重修，形成现存规模。
尼山孔庙现占地约16000平方米。有殿、堂、祠等81间，分为中、东、西三区。中区有两院，前为棂星门、观川亭、大成门、两庑、大成殿；后为两庑、寝殿；东区有讲堂、土地祠；西区有启圣王殿、寝殿，
毓圣侯祠。
夫子洞，又名坤灵洞，天然石室，位于尼山孔庙东南崖下。传为
孔子诞生处。洞中有天然石床，洞前立“夫子洞”石碑。