黄丕烈在
爱新觉罗·颙琰六年（1801）放弃仕途，辞去直隶知县职务后，专注于收藏、校对和著作。他的藏书中包含了丰富的古今
善本、秘本和珍本，尤其钟爱宋代书籍，因此自称“佞宋主人”。他收藏了超过一百种的宋版书籍，并专门设立了一间房间来存放这些书籍，命名为“百宋一廛”，并撰写了《百宋一廛书录》。他还编写了《百宋一廛赋》的注释，详细解释了版刻的来源和传承。为了更好地管理藏书，他在家中设立了多个藏书室，如“士礼居”、“读未见书斋”等共计十余个。晚年时，他在玄妙观前开设了“榜喜园书铺”，促进了书籍的流通。
由于
黄丕烈精通校勘工作，经过他校对的书籍在版本学和学术界都享有很高的声誉。许多藏书家和书商都热衷于收集黄丕烈“士礼居”的藏书。然而，由于生活困难，黄丕烈的藏书逐渐分散，最终被艺芸书舍、
杨以增、铁琴铜剑楼等知名藏书楼收藏。目前，他的藏书主要分布在中国的
中国国家图书馆、
上海图书馆、
南京图书馆、
北京大学图书馆以及台湾的“中央图书馆”。
黄丕烈还编辑了《士礼居丛书》，收录了22种稀有的书籍，并附带了校勘记录。这套丛书完成于
爱新觉罗·旻宁四年（1824）。此外，
广陵书社在2010年出版了《士礼居黄氏丛书（上、下册）》，汇集了他的藏书精跋和精校成果。