福建省淡水水产研究所（Freshwater Fisheries Research Institute of Fujian）成立于1984年10月，历史可追朔于1962年在
福州市成立的省水产研究所淡水分所。
截至2010年，研究所编制61人，在职职工55人，离退休人员27 人。在职职工中具有高级职称21人（其中5人未聘任），中级职称22人（其中9人未聘任），高、中级职称中占现有全所人员总数78%。
在职人员中具有硕士学位32人（其中硕士研究生21人），占全所总人数的58%，全所人员平均年龄38岁（其中35岁以下有23人，占42%）。有省“
国际劳动节”劳动奖章获得者1人，享受国务院特殊津贴者1人，全国青年科技奖、运盛奖获得者1人，列入省“百千万人才工程”2人，被农业部、省政府评为“有突出贡献农业科技工作者”1人，国家兽药典委员会委员1人，硕士研究生导师1人，受省厅以上部门表彰的15人。
截至2010年，研究所下设养殖育种研究室、水生生物疫病防控研究室、鱼类营养研究室、渔业资源与环境研究室，建有
福建省淡水水产研究所榕桥中试基地、福建省淡水养殖良种繁育场、福建省淡水渔业资源与生态环境监测站、农业部渔业污染事故调查丙级资质、福建省淡水鱼鱼病防治服务中心。
截至2010年，研究所所部占地面积6602m（已扣除宿舍房占地面积），其中科研办公楼1676.5m。榕桥中试基地自有土地125亩，其中综合办公楼869m，池塘水面76.6亩。全所拥有固定资产2105万元，其中各种仪器设备价值近500万元。
截至2010年，研究所先后承担国家科技部、农业部、省科技厅、省厅、省发改委、省农办等有关部门下达的科技攻关项目100多项，先后获得国家科技进步
二等奖1项，
三等奖1项，省部级科技奖二等奖7项，三等奖13项。还获得全国星火科技奖、省农业科技工作先进单位等10多项表彰和奖励。
2001年至2010年，共鉴定、验收项目49项，现在研项目有41项。2006年至2010年，共发表了各类学术论文144篇，出版科技专著和4部，申请专利5件，制定国家行业标准2项，省地方标准5项。