广西医科大学基础医学院的前身是医学基础部，始建于1959年1月，1998年9月更名为基础医学院。学院拥有学院办公室、教研科两个行政科室，以及多个教研室和实验室。学院的人体解剖学与组织胚胎学、病理学等学科具有博士学位授予权，同时还有多个学科具有硕士学位授予权。学院注重教学科研的可持续发展，强调以人为本，致力于构建和谐的学习环境。

广西医学院建院初期，学院下设学院办公室、教研科、学生工作办公室、学院团委等4个行政职能部门，现有基础医学系、生命科学与技术系、生物医学工程系、基础医学实验教学中心等4个教学系（中心），共12个教研室，其中：基础医学系涵盖6个教研室，即微生物学教研室、免疫学教研室、人体解剖学教研室、组织学与胚胎学教研室、病理生理学教研室和寄生虫学教研室；生命科学与技术系涵盖4个教研室，即生理学教研室、生物化学与分子生物学教研室、生物技术教研室和细胞生物学与遗传学教研室；生物医学工程系涵盖2个教研室，即物理学教研室、数学与信息工程学教研室；基础医学实验教学中心涵盖3个教学实验室（中心），即机能学实验教学中心、形态学实验教学中心、分子医学实验教学中心；2个科研实验室，即基础医学中心实验室、广西壮族自治区“神经科学研究”特聘专家实验室。

学院现有教职员工207人，其中专任教师129人，博士85人、硕士88人，具有正高职称26人、副高职称55人。近年来，先后荣获国家“万人计划”教学名师1人、国家高层次人才计划1人、国务院政府特殊津贴专家2人、广西留学回国人员先进个人1人、教育部基础医学教学指导委员会委员1人、“中国青年解剖科学家奖”1人、广西高校人才小高地“八桂学者”1人、广西特聘专家3人、广西优秀专家1人以及广西“新世纪十百千人才工程”第二层次人选2人；广西壮族自治区高等教育研究突出贡献学者1人、广西高校“桂林市名师”1人、广西高校“教学名师”1人、广西“优秀教师”2人；广西“先进工作者”1人、广西“全国五一劳动奖章”5人、广西“青年五四奖章”1人、“广西青年科技奖”2人；荣获“全国党建工作样板支部”1个、广西“工人先锋号”集体1个。

基础医学院拥有一支结构合理的专业技术队伍，包括教师和其他专业技术人员。教师团队中，博士学位持有者占一定比例，且有多位博士生导师和硕士生导师。学院的专业技术人员涵盖了不同级别的职称，形成了完善的职称体系。

基础医学院承担着多种层次和专业的基础医学课程教学任务，开设了丰富的必修和选修课程。学院在教学和科研方面取得了多项成就，包括国家级和省级的教学奖项，以及科研项目的资助和研究成果。学院鼓励国际学术交流，与多个国家建立了合作关系。