中国农业科学院果树研究所成立于1958年，是以苹果、梨、葡萄、桃、李、杏、草莓、蓝莓、猕猴桃、车厘子、枣等果树为研究对象的国家级科研机构，是国家果树战略科技力量。经过多年的发展，形成了涵盖种质资源、遗传育种、栽培生理、植物保护、贮藏加工、质量安全、科技信息等学科体系，创建了种类齐全、学科完整、特色鲜明、优势明显的研究体系。

中国农业科学院果树研究所始建于1958年3月，其前身为东北农业科学研究所兴城园艺试验场和华北农业科学研究所园艺系果树室。

1970年下放眉县，与陕西省果树研究所合并。

1978年8月，从陕西省眉县迁回辽宁省兴城市。

1981年，创建国家果树种质兴城梨、苹果圃。

2003年，国家科技部批准，依托中国农业科学院果树研究所组建国家苹果育种中心。

2007年，中国农业科学院兴城农村实用技术培训中心成立。

2008年，获批建设农业部园艺作物种质资源利用重点实验室。

2009年7月，葫芦岛市少数民族培训基地在果树研究所举行揭牌仪式。

2010年12月，果树所召开青年工作委员会成立大会。

2012年7月，中国农业科学院果树研究所和意大利巴里大学建立“中—意果树科学联合实验室”。

果树种质资源研究中心

果树遗传育种研究中心

果树栽培生理研究中心

果树植物保护研究中心

果品贮藏加工研究中心

果品质量安全研究中心

果树科技信息研究中心

• 设备仪器

• 数据库资源

截至2017年7月，研究所拥有CNKI系列数据库、国研网、万方标准全文数据库（行业标准）、万方标准全文数据库（国家标准）、中国科学引文数据库（CSCD）、ScienceDirect （Elsevier）、SpringerLink、Wiley Online Library、Taylor \u0026 Francis、Science Online、Nature NPG、PNAS、Annual Reviews、American Society Microbiology Journals...、American Chemical Society Journals（ACS...、American Society for Horticultural Sci...、SpringerProtcols、ProQuest博硕士学位论文全文数据库、Proquest 生物、农业期刊全文数据库、Journal Storage、OECD iLibrary、CAB Plus（Full Text from CABI）、CAB Compendia、Web of Science （SCI/CPCI）、Journal Citation Reports （JCR）等数据资源。

截至2008年10月，研究所共承担国家、部（省）、市和中国农业科学院各级科研课题380余项。作为主持单位取得科研成果148项，其中99项成果获得各级奖励。先后获得全国科学大会奖1项、国家科学技术进步奖9项、国家自然科学奖1项、农业部科学技术进步奖13项、农业部科技成果技术改进奖29项、中国农业科学院科学技术成果奖7项一系列成果。

据2017年11月研究所官网显示，研究所建所以来，承担了国家及部省级科研课题400余项，取得重大科研成果150余项，为我国果树科技创新、果树产业发展与服务“三农”做出了重要贡献。

截至2017年6月，育成果树新品种32个，作为主持单位获奖173项，其中国家奖7项、省部级奖82项。

• 《中国果树》

《中国果树》是农业部主管、中国农业科学院果树研究所主办的果树技术期刊，主要报道中国果树生产和科研新成果及进展，交流果树生产先进技术，提供国外果树科技信息，普及果树科技知识，主要栏目有试验研究、试验简报、经验交流、专题综述、调查报告、生产建议、实验技术与方法、国外果树科技、来稿选登、新品种选育、果业论坛、名优品种与果品等。入选为园艺类核心期刊、全国中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国科技期刊精品数据库收录期刊、中国期刊方阵双百期刊。

• 《果树实用技术与信息》

《果树实用技术与信息》是由中华人民共和国农业部主管，中国农业科学院果树研究所主办的果树类期刊。主要有专家论坛、果业动态、果树栽培技术、果树医院、果农顾问、果品贮藏与加工、优新品种、新技术、新农药、产销动态、市场行情、果园综合开发、果树珍稀资源、知识角、市场营销等栏目。

研究所标识中间是一棵结着果实的树的图案，研究所英文简称IP构成一棵树的主干，下方为波浪形线条构成的土壤。研究所英文全称环绕在果树的上方。

求实创新，拼搏发展。

2014年10月11日，中国农业科学院果树研究所科研处为在所研究生组织了“提升综合素质系列活动”之“迎国庆，爱祖国”登山活动。