中山大学法医鉴定中心依托中山大学设立。1953年成立法医鉴定组，1998年成立法医鉴定中心，2000年被广东省政府指定为唯一的法医学专业类复核鉴定机构。

2020年1月2日，中山大学法医鉴定中心被公示为“全国公共法律服务工作先进集体”（公示期为2020年1月2日至2020年1月8日）。

中心是经司法行政机关审核登记的司法鉴定机构，核定的司法鉴定业务范围包括：法医病理鉴定、法医临床鉴定、法医物证鉴定、法医毒物鉴定、法医精神病鉴定。现有鉴定工作人员46名，其中司法鉴定人23名，鉴定辅助人员23名。高级职称司法鉴定人20名，占司法鉴定人的87.0%，司法鉴定人中有博士学位、硕士学位和学士的人员分别占69.6%、26.1%和4.3%，拥有高素质的专家型司法鉴定人团队。

中心长期以来为全国的公、检、法、司和个人的民事及刑事案件提供法医鉴定工作。各专业迄今共受理和鉴定6万余例案件，法医病理、法医临床和法医物证等三个主干专业的年检案总量大于5000例，检案数量大，疑难案件多，重复鉴定案件比例高，在一些疑难和敏感案件的鉴定中发挥了重要的作用。

2008年7月，中心通过中国合格评定国家认可委员会的实验室/检查机构认可。