石兴祖，石天禄的儿子，继承了父亲的千户职位，担任武略将军一职。

石兴祖在己未年间随军攻打南宋，参与进攻鄂州的战役。至元四年，他率领军队从宿州出发，沿着淮河一带的各个郡县进行搜查，抓获了十多名宋朝的侦察人员。他的这一行动得到了统军司的高度赞赏，被奖励了二十匹马、五百两白银以及二十件锦缎。至元十二年，他在攻打常州时担任先锋，其战功超过了其他将领。随着南宋的灭亡，石兴祖因功绩而晋升为宣武将军及管军总管，负责守卫温州地区。在此期间，他成功镇压了当地叛乱分子林大年的势力，歼灭了一千余名敌人，并说服了三万多户居民返回农田务农。至元十六年，他又因为卓越的表现被提升为显武将军，并获得了金虎符作为象征权力的信物。然而，在至元十九年七月，石兴祖不幸在军中去世。他的儿子石璡随后继承了他的职务。

石兴祖的儿子石璡在他去世后继任了他的职务。