南华大学学报分为
自然科学版和
社会科学版两个版本。自然科学版曾用刊名：
中南工学院学报；南华大学学报(理工版);衡阳工学院学报。社会科学版创刊于1999年10月，是南华大学主管、主办的综合性学术理论期刊。
本刊主要刊登本校的
基础医学和
临床医学论文，适当发表校外的优秀论文。凡国家自然科学基金课题和重大攻关项目论文免收发表费，其他论文适当收取
版面费。本刊自办发行，委托
天津市“非邮发报刊联合发行部”对外征订。主要反映我校科研、教学、医疗等方面的新成果、新技术和新经验。内容包括基础医学、临床医学、预防医学、祖国医学、药学、临床病理（例）讨论、临床护理、新技术新方法介绍、短篇报道、
文献综述等，促进医学事业的发展。读者对象为中、高级医学科技人员。
《南华大学学报·社会科学版》是南华大学主管、主办的综合性学术理论期刊。创刊于1999年10月，双月刊，大16开，120页，国内外发行。主要设置核工业经济与管理、衡岳论坛、
政治学哲学研究、
经济学研究、
管理科学研究、语言文学研究、
历史学法学研究、教育学·心理学研究、信息学·
传播学研究、艺术与设计等10个专栏。其中，
中核集团经济与管理、衡岳论坛为特色栏目。
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