京都大学综合博物馆（Kyoto University Museum），成立于1997年，是日本京都的一座综合性博物馆，也是京都大学内部的重要教育研究设施。博物馆旨在整理并公开京都大学自成立以来积累的丰富学术资源，包括约260万件教育资料和各类学术标本。展览内容涵盖自然科学、人文历史和技术发展等多个领域。

京都大学综合博物馆的展览分为三个主要主题：自然史、文化史和技术史。同时，博物馆还展出了来自中国和韩国考古发掘的珍贵物品。作为京都大学博物馆协会的一员，京都大学综合博物馆与其他十三所高校博物馆构成了一个紧密联系的网络。