1961年10月，省教育厅、省卫生厅发文，学校定名为
浙江省舟山卫生学校。1962年春，省厅作出撤销学校的决定。1963年2月，舟山地委、行署作出恢复学校的决定后，学校加快了发展步伐。1963年5月，学校从医院兼管体制转变为单独建制。1982年2月，舟山行署批准建立舟山地区卫生干部进修学校，与学校实行一套班子、两块牌子。1987年3月，
舟山市人民政府下文，将原
定海区卫生学校并入学校。2000年3月，经
浙江省人民政府批准，浙江省舟山卫生学校并入
浙江海洋大学，改建为以开展高等医学职业教育为主的浙江海洋学院医学院。