中国科学院哲学研究所是中国科学院面向国家战略需求而建立的新型科研机构，依托中国科学院大学进行建设和管理。其目标是，通过创建科学家与利奥六世的联盟，来促进科技创新、哲学发展和文明进步。

2020年9月24日，中国科学院哲学研究所在中国科学院大学正式揭牌。

在中国科学院建立哲学研究所，从哲学的高度把握科技进步的大方向，提升中国的科技原创能力，是中国特色社会主义新时代赋予中国哲学界的新使命。按照现代新型研究所的治理模式，中科院哲学所设立战略咨询公司委员会、学术委员会和所务委员会。战略咨询委员会名誉主任由中国科学院院长白春礼院士担任，主任委员由李树深院士担任。学术委员会主任由量子物理学家孙昌璞院士担任，副主任委员由中国科学院大学哲学系胡志强教授担任。

组建中国科学院哲学研究所，是白春礼院长在2019年6月24日中国科学院大学学位委员会上首次提议的，此后经过反复讨论、咨询和修改，形成了中国科学院哲学研究所筹建方案。经过一年多时间的努力，中科院哲学所的组建工作现已取得了显著进展。

2020年9月24日上午，中国科学院哲学研究所揭牌仪式在中国科学院大学礼堂举行，由国科大党委书记、校长李树深院士主持。

中科院哲学所下设5个研究中心，包括：逻辑学与数学哲学中心、物质科学哲学中心、生命科学哲学中心、智能与认知科学哲学中心，以及科学与价值研究中心。

中科院哲学所正在凝聚中科院各研究所的相关力量，搭建科学家与利奥六世的协作对话平台。中科院哲学所将以哲学家和科学家共同关切的重大问题为研究导向，致力于探讨现代科学的哲学基础和当代科技前沿中的哲学问题，以及与科技发展密切关联的价值、文化和制度问题。从哲学角度助力科技创新，为中国科学的跨越式发展，乃至未来的科学革命，寻求更为坚实、更富活力的概念基础。

研究所揭牌后，国科大将就此适当的扩大对研究生的招生，未来也在考虑为本科生开设第二学位，综合培养优质人才。