合同备案是指加工贸易企业在主管海关对其所持有的合法加工贸易合同进行备案，并申请保税以获取相关凭证的行为。
备案企业
经营企业
指负责对外签订加工贸易进出口合同的各类进出口企业和外商投资企业，以及经批准获得来料加工经营许可的对外加工装配服务公司。
加工企业
指接受经营企业委托，负责对进口料件进行加工或者装配的企业。这些企业应具备法人资格，或是由经营企业设立的虽不具有法人资格，但已取得工商营业执照并实行相对独立核算的工厂。
备案内容
单证
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中华人民共和国商务部主管部门签发的“加工贸易业务批准证”和“加工贸易企业经营状况和生产能力证明”。
- 加工贸易合同或其副本。
- 加工贸易合同备案申请表及企业加工贸易合同备案呈报表。
- 如涉及加工贸易国家管制商品，则需提交主管部门的许可证件或其复印件。
- 为确定单耗和损耗率所需的相关资料。
- 其他必要的备案单证。
商品
- 加工贸易禁止类商品不得备案。
- 需要提供进出口许可证或两用
物项进出口许可证的商品，如消耗臭氧层物质、易制毒化学品、监控化学品等。
- 需要提供其他许可证件或批准文件的商品，如进出口音像制品、进口工业再生废料等。
保税额度
- 海关准予备案的料件，包括为履行产品出口合同而进口的直接用于加工出口产品的数量合理的触媒剂、催化剂、磨料、燃料等，将享受全额保税待遇。
- 对于海关不予备案的料件，如试车材料、非列名消耗性物料等，进口时将按照一般进口货物的规定征收关税。
台账制度
根据加工贸易银行保证金台帐分类管理原则，不同类别企业的处理方式有所不同。具体而言：
特殊情况
- 进口料件金额在1万美元及以下的AA类、A类、B类企业可以不设置台账，即“不转”。
- AA类、A类、B类企业进口金额在5000美元及以下的列名的78种可供服装辅料，不仅不需要设置台账，还可免领手册，但须向海关备案。