小孤山水电站位于甘肃省境内黑河上游，是黑河干流上的第6座梯级水电站。

工程采用引水式开发，由首部枢纽、引水系统、地下厂房和升压站等建筑物组成，电站装机容量102MW。

枢纽处河谷狭窄，呈“V”字形，地形自然坡度65º~85º，河谷宽72m。建基高程以下河床覆盖层最大厚度35m，各层分别为：①冲洪积粉质粘土夹大孤石层，埋深5～16m；②冲洪积砂卵砾石层，埋深7～22.5m；③冰渍含砾砂壤土，埋深22.5～32m；④冰渍含砾块石碎石土，埋深32～35m。

枢纽采用闸坝型式，最大坝（闸）高27.5m，上下游最大水头差22m。是目前国内建于淤泥质软土地基上最高的水闸。工程于2003年10月开工建设，2006年完工。