2012年,殷玉麒担任《香菇特勤队第1季之胡萝卜入侵》《香菇特勤队第2季之果蔬小英雄》以及《香菇特勤队第3季之英雄归来》的导演。2013年,他继续担任动画系列片《怪物山》的导演,并执导了《赛尔号大电影3:战神联盟》。2014年,殷玉麒担任《
神笔马良》的执行导演,并执导了《赛尔号大电影4:圣魔之战》。2016年,他担任国创仙侠3D动画《
太乙仙魔录之灵飞纪》第一季的总监制、总策划、总制片人,并担任《爸爸去哪儿第二季动画版》的总导演、总制片人。2017年,殷玉麒继续担任《太乙仙魔录之灵飞纪》第二季的总策划、总制片人。2018年,他担任番剧《
别惹流氓兔马修》的导演、剧本统筹。2019年,殷玉麒担任动画《派乐萌奇》的导演,并继续担任《太乙仙魔录之灵飞纪》第三季的导演、总制片人。同年,他被任命为
中国戏剧文学学会理事。
2014年11月,殷玉麒获得2013—2014年度
苏州市吴中区“文化产业重点人才”称号。此外,他还荣获国家文旅部“戏剧中国”2021年度突出贡献者称号。