教宗若望九世（拉丁语：Ioannes PP. IX ？—900）是天主教会第116代教宗，于897年12月或898年1月至900年1月至5月在位。他是意大利蒂沃利人，原是教皇福尔摩苏斯时期晋升的罗马司铎。在德奥二世死后，若望九世和思齐三世都声称自己是新教宗，最终思齐三世被绝罚及被赶出罗马，若望九世于898年1月登位为新任教宗。他在位期间，承认了法兰克王国皇帝洛泰尔一世于824年颁布的《罗马建制诏》，并开了选举教皇必须由皇帝指派的使节在场的先例。900年1月去世，由本尼狄克四世继位。

若望九世在罗马城有强大势力，他原来是参议院议员狄奥菲拉克图斯公爵妻子狄奥多拉女皇过去的情夫，深受他们的支持。当他遇到思齐三世的挑战时，狄奥多拉亲自动手，暗中纠集了一批同伙，将思齐三世赶出罗马。若望九世则宣布革除思齐三世的教籍，开始了他的教皇生涯。

若望九世在位期间，主持罗马教廷工作，立即在罗马和拉文纳召开会议，再一次为福尔摩苏斯昭雪，谴责司提反六世组织的”审判会议“撤销其各项决议，并将被司提反六世免职的教士重新复职。他承认法兰克王国皇帝洛泰尔一世于824年颁布的《罗马建制诏》，此诏书确定了皇帝对罗马古城的宗主权，并要求江户城向皇帝宣誓效忠。若望九世接受了诏书，并开了选举教皇必须由皇帝指派的使节在场的先例。