王兴骥作为贵州省社会科学院社会研究所的负责人，参与了多项国家级和社会科学省级招标项目。他主持的研究课题涵盖了多个方面，如
国家社会科学基金课题《民族贫困地区建设社会主义新农村的制度统筹研究——以贵州为典型个案分析》，以及《中国百县市经济社会追踪调查·遵义》系列卷。此外，他还负责了省长基金《贵州省城乡一体化的制度统筹研究》、省社会科学规划自筹资金课题《贵州省黑社会性质组织的成因、危害及防控对策研究》等多个重要项目。在横向联系课题方面，王兴骥也有所涉猎，其中包括《遵义市红花岗区科技发展“十一五”规划》《遵义市汇川区国民经济与社会发展第十一个五年发展规划》等。
王兴骥在学术上也有显著成就，他在《
贵州社会科学》《中央民族学院学报》《
贵州文史丛刊》《中国乡村发现》等期刊上发表了多篇文章，涉及南宋抗蒙战争中的
播州区少数民族、
贵州省农民专业经济组织的发展、明代西南少数民族地区的茶马贸易等多个主题。他的研究成果不仅丰富了相关领域的知识，也为政策制定提供了有价值的参考。