塞浦路斯侏儒河马（学名：Hippopotamus minor）是一种已灭绝的河马，生活在全新世早期的塞浦路斯岛上。

塞浦路斯侏儒河马重约200公斤，与现存的倭河马差不多大小。但是它们缩小的原因相信是岛屿侏儒化，因细小的环境而限制了基因的发展。估计它们高约76厘米及长121厘米。

更新世地中海侏儒河马还有：克里特侏儒河马（ Hippopotamus creutzburgi）、西西里马耳他侏儒河马（ Hippopotamus melitensis）、西西里马耳他河马（ Hippopotamus pentlandi）。

塞浦路斯侏儒河马于11000-9000年前期间灭绝，当时是塞浦路斯上最大型的动物。它们是草食性的，并没有天敌存在。在塞浦路斯的发掘位点提供了证据，显示塞浦路斯侏儒河马可能是因在塞浦路斯的早期人类而灭绝的。

在塞浦路斯的发掘位点中，发现了与塞浦路斯侏儒河马骨骼相关的人类遗物，这些遗物的年代约为12000年前。一些学者认为，这些证据表明，早期的塞浦路斯人类可能是导致塞浦路斯侏儒河马灭绝的原因。然而，这一观点受到了一些学者的质疑，他们认为，塞浦路斯侏儒河马的骨头可能在人类居住该地区之前就已经积累在那里，人类在骨头积累后才开始在该地区定居。