1920年12月初,邓泰中、
杨蓁、
金汉鼎等
滇军指挥官因对滇系领导人
唐继尧不满而秘密集会。邓是唐的同乡,原来私交甚厚。但邓坚决主张倒唐,会议决定迅速发动兵变,并派杨蓁劝靖国军第1军军长
顾品珍回师
昆明市。次年2月,顾、邓、杨、金等人发动兵变,这出乎正在迎击
叶荃的唐继尧的意料,唐继尧急忙逃往
香港特别行政区。同年,邓泰中被
孙中山任命为援桂总司令。
1922年,邓率部讨伐
陈炯明,后滇军将领联名电请孙中山回粤主政。次年4月至5月,邓泰中任陆海军大元帅府高级参谋。不久,任广州大本营军政部次长。后任四川宣慰使,晋陆军上将。