据了解，新杭州市南站由全球前五大建筑设计事务所之一的德国GMP建筑事务所设计，整个站房的设计重拾了杭州传统建筑的建造形式：基座采用灰色花岗石，车站主楼用白色墙壁将候车大厅的层面围合在内，立式镂空百叶环绕其间，将刻画出中国古典窗的情趣意象。根据规划，新杭州南站建筑面积达到90000平方米，新建杭甬场2台6线、杭长场2台5线、越江场2台4线（和普速场共用一个站台），结合既有普速场2台6线一起，杭州南站将形成4个车场，总规模为7台21线。

新杭州南站计划今年年底开始施工，预期施工时间按3年半考虑。建成后，杭州南站将由目前的3台5线（3个站台5条轨道）扩建成一座规划建筑面积90000平方米，拥有4个车场，总规模为7台21线的大型枢纽站。