弘治九年，登进士，曾就刑部典吏徐珪以满仓儿案上疏弹劾中官杨鹏得罪而上疏声辩，不为孝宗接纳。久之升为
吏部主事。
正德年间，因上疏抗议宦官干政，而被刘瑾诬陷为奸党，勒令归乡。刘瑾被诛杀后，起用为河南佥事，后因事连坐被罢免。
清·
张廷玉等，《明史》（卷189）：“孙磐，
辽阳市人。弘治九年
进士。观政在部时，刑部典吏徐珪以满仓儿事劾中官杨鹏得罪，磐上疏曰：「近谏官以言为讳，而排宠幸触权奸者乃在
胥吏，臣窃羞之。请定建言者为四等。最上不避患害，抗弹权贵者。其次扬清激浊，能补阙拾遗。又其次，建白时政，有裨军国。皆分别。而粉饰文具、循默不言者，则罢黜之。庶言官知警，不至旷」时不见用。磐寻擢
吏部主事。正德元年，宦官渐用事，磐复上疏曰：「今日弊政，莫甚於内臣典兵。夫臣以内称，外事皆不当预，可使握兵柄哉。前代盛时，未尝有此。唐、宋季世始置监军，而其国遂以不永。今九边镇守、监枪诸内臣，恃势专恣，侵克百端。有警则拥精卒自，克敌则纵部下攘功。武弁藉以缘，宪司莫敢讦问。所携家人头目，率恶少无赖。吞噬争攫，势同狼虎，致三军丧气，百职灰心。乞尽撤还京，专以边务责将帅，此今日修攘要务也。」不从。及
刘瑾得志，斥磐为奸党，勒之归。瑾诛，起
河南省佥事，坐累罢。”