小双孢菌属（学名：Microbispora）为链孢囊菌科的一属细菌，属于
放线菌门、放线菌纲、放线菌
亚纲、
放线菌目、
小多孢菌科。此属的模式种为
玫瑰小双孢菌(Microbispora rosea)。小双孢菌属的特征在于在气生菌丝上形成纵对的孢子，有或无柄，先形成蕾芽，后膨大，由横隔分开，逐渐形成两个球形或椭圆形的孢子。
本属的特征在于在气生菌丝上形成纵对的孢子，有或无柄，先形成蕾芽，后膨大，由横隔分开，逐渐形成两个球形或椭圆形的孢子。基丝上无孢子。孢子直径1.2-1.8微米，无柄或在
短柄顶端。大多数种的气丝粉色。革兰氏阳性，
细胞壁Ⅲ型。几个种在
燕麦粉琼脂等培养基内形成碘色菌素(iodinin)的
青铜紫针状结晶。生长需要B族
维生素，特别是硫胺素。中温和兼性嗜热。正常情况下，生活在土壤和湖泥内。
玫瑰小双孢菌Mb．rosea偶尔牵连到
心包炎和胞膜炎。