蕰藻浜自明万历四十八年至清光绪十六年（1620~1890年）间，有9次
疏浚。1949年前，大部分河段在宝山区境内，嘉定段西起走马塘鸭棚头，东北至花园浜，长2.5千米。清嘉庆年间（1796~1820年），由于嘉定南部干河泥沙淤积，遂于清
咸丰九年（1859年）在区界附近唐家桥建置石闸，以拒浑潮；清同治三年（1864年），改筑为泥坝。清光绪十六年（1890年）宝山疏浚蕰藻浜后，拆除土坝，
嘉定区又选择唐家桥以西新址重建石闸，不久闸前淤积成坝，东西两段互不沟通。
1949年后，政府为改善当地排水条件，于1952年12月
疏浚蕰藻浜嘉定段，并带浚走马塘一段，总长3.78千米，同时挖除闸坝，与
宝山区境内之东段贯通。1959年冬，根据市城建局规划定线，蕰藻浜自宝山塘桥以西改道，由原向西南改向西北，裁弃曲湾，直趋境内横沥，国家投资220万元，挖土77.62万立方米。1978~1981年，蕰藻浜自横沥向西开拓延伸，于黄渡孟泾村接
吴淞江。
经国家交通部和上海市人民政府批准，自1991年11月至1996年9月，蕰藻浜航道实施清淤、护坡工程，共投入资金5779万元，清除河坡泥土54.9万立方米，两岸建造石驳护坡34.815千米，新建、改建桥梁4座。建成后的蕰藻浜航道，河宽水深，河坡整齐坚挺，也是
上海市现存的除
长江、
黄浦江以外不多见的可以通行百吨级
货船的河道之一。蕰藻浜宝山境内长15.6千米，是重要的滨水空间承载体，其中东起共和新路高架桥西至康宁路桥，约1.4千米的庙行区段于2021年6月25日正式贯通。
蕰藻浜，位于上海市
嘉定区南部，
宝山区中部。其西起
吴淞江（吴淞江），东至黄浦江（吴淞口），全长34.64公里。嘉定区境内全长17.94公里，宝山区境内全长16.7公里。
明万历四十八年（1620），嘉定知县单迈主持
疏浚蕰藻浜，使河道长达二十余公里。清顺治八年（1651）至
同治六年（1867），先后疏浚7次。解放后，蕰藻浜又经多次疏浚，成为横贯嘉定、宝山的一条干河。
太平军曾凭借蕰藻浜河道，抗击英法联军。
一二八淞沪抗战时期，蕰藻浜又是
战略要地。
淞沪会战的指挥部设在嘉定南翔镇，日军企图占据蕰藻浜要隘，以切断吴淞与
闸北区的关系，对十九路军与
国民党第五军实行分割包围，中国军队与日军展开了殊死战斗。“八一三”抗战中，中国军队面对日军的飞机、坦克，守卫
吴淞大桥，展开了三次
白刃战，终于打退日军这是“八一三”战争中最大的一次反击战。蕰藻浜，是一条英勇的河，不屈的河！