芬陀院是东福寺的分寺之一。是元享年间(1321～24年)，从事关白（天皇的辅佐）职务的一条经通氏为了祭祀自己父亲而创建的寺院。后来由于火灾等而衰退，在元禄年间(1688～1704年)由天皇的近身一条兼辉进行了重建。

芬陀院内有室町末期的画家-雪船等杨氏修筑的庭院「鹤龟」，别名「雪舟寺」。另外，院内还有可以饮茶的「惠观堂」，是在江户时代被叫做「茶关白」的一条惠观氏，因为每当到东福寺进行参拜的时候，都要饮茶而兴建了「图南亭」，惠观堂就是由图南亭改建而来的。