包囊（孢囊），也称“胞囊”，是原植体植物（如分裂菌、硅藻、绿藻门等）和原生动物界（如痢疾内变形虫等）在休止状态或外界环境条件改变时，身体外围分泌的一种蛋白质的膜，用以度过不良环境。在较高等的动物，如扁形动物门中的一些吸虫（中华分枝睾吸虫等）生活史中也可以形成类似包囊的虫体，称为“囊蚴”。

包囊是原虫生活史中一个具有较坚韧外壁的时期，不能活动和摄食。大多数原虫生活史中有着滋养体、包囊两个时期，其中包囊期对外界不利因素的抵抗力较强，常是一个传播和感染期。

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1. [方]：装杂物的小包袱；囊袋。如：包囊中什么小东西都有。

2.低等动物在环境恶劣时分泌出一种蛋白质薄膜包围于体外。

原生动物界在不良环境下，虫体会分泌一种保护性胶质将自己包裹起来，形成包囊。坏死物质难于溶解吸收，或不完全机化，最初由肉芽组织包裹，以后则为增生的纤维组织包裹。

包囊（packaging）是指噬菌体脱氧核糖核酸被包入噬菌体的头部之中。噬菌体感染细胞后能独立进行DNA复制和形成噬菌体粒子，增殖的DNA裹入噬菌体的头部，进而完成噬菌体粒子装配。如裹入噬菌体，则这一反应也能在试管内再现。在被包入的DNA中，必须具有黏性末端(COS)的结构和一定范围的大小(分子量1.9 ×107～3.0×107)。在试管中把重组的DNA裹入到噬菌体头部，通过感染可高频率地进入细菌中，因而成为基因工程中经常采用的一种重要方法。