《魔法少女小圆》是由ハノカゲ作画，芳文社发行的漫画，改编自电视动画。漫画分为两部分，一部分是本篇，另一部分是《魔法少女小圆魔兽篇》，背景位于本篇和新篇中间的时间段。日文版单行本共有3卷，繁体中文版由东立出版社代理发行，简体中文电子版由哔哩哔哩漫画发布。

在见泷原初中普通二年级的鹿目圆经历了一场改变她命运的邂逅。这是新的魔法少女故事的开幕

鹿目圆的愿望实现，所有的魔女消失，小圆自身也化身为圆环之理，除了晓美焰之外，没有人还记得小圆。取代魔女是来源不明的魔兽。为此晓美焰、巴麻美、佐仓杏子和美树沙耶香等人对魔兽展开了激战。

※设定解说部分除了新世界的不同设定外完全与《魔法少女小圆》动画版设定相同

[魔兽篇]由本篇漫画版的作画ハノカゲ执笔，企画的准备期较长。ハノカゲ先是与狗咖喱和新房绍之以监修和出主意的形式开了碰头会，然后多次详细修改文字构思后开始画草稿。（魔兽以及其他设定设计方面多由狗咖喱负责）由于后期剧情过于复杂以及设定越来越慎密后加入了助手帮忙，一年半的连载后[魔兽篇]完结。