该寺约始建于唐或宋，原名真教寺，宋末遭毁，元代得西域伊斯兰教大师
阿老丁（Ala al-Din）捐资重建。民国十七年（1928）原照壁、寺门、望月楼和长廊等因道路拓宽拆除。1953年大修，至今保存较好。因其建筑群形似
不死鸟，故
清代时又称凤凰寺。
中国伊斯兰教著名清真寺，因其建筑群布局形似凤凰，称为“凤凰寺”,又名“真教寺”.位于浙江省杭州市上城区中山中路(
南宋御街)上，占地面积约2600平方米，建筑面积约1370
平方米、
礼拜殿面积约570平方公尺，寺内有水房及殓建筑面积房等附属设施，是伊斯兰宗教节庆活动的主要场所，也是杭州伊斯兰教的礼拜中心。凤凰寺历史悠久，创建于
天宝（618—907），宋时（960—1279）被毁。元代（1281年）著名
伊斯兰教人物
阿老丁开始重修，明代（1451—1493年）期间再次扩建重修，最终形成凤凰寺的建筑群规模。1646年，清朝政府下令再次重建，成为当时中国规模最大的清真寺之一。杭州凤凰寺与扬州仙鹤寺、广州怀圣寺、
清净寺齐称“中国四大古寺”。