医疗保险机构是在医疗保险活动中负责承办医疗保险费用的筹集、管理和支付等业务的机构和组织，即医疗保险系统中的保险人。它们在医疗保险系统中占据主导地位，通过控制资金流和监管医疗服务提供者和被保险人的行为，确保医疗保险基金的安全和系统的正常运转。

根据医疗保险机构独立经营的程度，可分为三种类型：- 政府机构型：这类机构基本按政府计划行事，被视为政府的派出机构，其成员类似于国家公务员。- 独立经营型：这类机构在经营方面基本独立，遵循政府法规并接受监督。商业保险公司常为此类。- 中间型：大多数国家的医疗保险机构属于此类型，既有政府统一规划，也有相对独立的经营权。

医疗保险机构是非营利性机构，不同于营利性商业保险公司。它们的目标是管理好被保险人的保险资金，而非追求高额利润。此外，医疗保险机构通常是国家法规的执行机构，其自主经营权受到限制。

设置和分布

医疗保险机构的设置取决于被保险人的数量。理论上，一个机构所承保的人数越多，抵御风险的能力越强。实际设置时，可能以地区、行业或市场需求为基础。

组织系统

医疗保险机构通常不是单一组织，而是构成组织系统的一部分。大型机构可能设有分支机构，地区间的机构可组成联合体，共同协调和指导业务。

部门设置

医疗保险机构内部通常设有办公室、保险办理部门、医疗服务管理部门、财务审计部门、基金营运部门和信息部门等职能部门。

人员配置

医疗保险机构需要配备管理人员、经济师、保险业务人员、财会人员、保险医师和信息工程技术人员等多种专业人才。

医疗保险机构的任务包括参与制定政府医疗保险法规、筹集资金、保证医疗服务提供、支付医疗费用、监督和控制医疗服务提供方和被保险方的行为，以及管理医疗保险基金。

1. 加强政府对医疗保险系统的调控作用，通过政策法规和监督检查等方式，维持医疗保险机构的自主经营权在政府调控之下。2. 把握医疗保险机构自主经营的范围和尺度，赋予其一定的自主权，同时加以适当限制，以防止风险性选择。3. 在内部管理上，医疗保险机构可采用企业化的管理模式，提高效率和效益。