新疆艺术学院舞蹈系的历史可以追溯至1951年的西北艺术学院少数民族艺术系。随着新疆艺术学院的发展，于1958年成立了舞蹈科，后逐步发展成为现今的新疆艺术学院舞蹈系。

舞蹈系目前设有舞蹈教育、舞蹈史论、舞蹈表演、舞蹈编导等四个专业方向。

舞蹈系致力于成为新疆舞蹈教育领域的先锋，积极应对高等教育的变革和发展。其办学目标是培育具备深厚审美感知力和创新思维能力的专业舞蹈艺术人才，同时具备一定的教学能力和初步科研能力。此外，舞蹈系还旨在建设自治区民族舞蹈专业艺术和舞蹈师资人才培养基地，推动新疆舞蹈艺术科学的研究，并保护和弘扬新疆的原生态舞蹈文化。