佛教慧因法师纪念中学，成立于1987年，是香港佛教联合会开办的第十一所政府资助男女中学，也是长洲首家由佛教团体主办的学校。

佛教慧因法师纪念中学创立于1987年，为香港佛教联合会开办之第十一所政府资助男女中学，亦为长洲第一所由佛教团体主办之学校。

香港佛教联合会为纪念澳门普济禅院己故大德慧因法师慈悲度生之弘愿，兴学育才之遗志，特将本校命名佛教慧因法师纪念中学，以彰盛德，永垂景仰。

学校提供宽广而均衡的新高中课程，开设十个选修科目，并提供应用学习课程。其他学习经历方面，设有正规课堂以推展德育及公民教育、体育发展、艺术发展、社会服务、与职业有关经验等。此外，为学生建立《学生学习概览》。

家教会资助“阅读王计划”；英文科获教育局资助二百万推行“英语提升计划”；香港赛马会资助推行“共创成长路计划”。

在校际香港特别行政区历史文化考察比赛中曾取得一次亚军，两次季军及四次优异奖，本年度更获得初中组冠军。中七理罗茹及林伟汶获离岛区杰出学生高中组优异奖。

推行佛化教育，五育并重，校风纯朴，积极培养学生自律自爱的精神。中一至中五采用双班主任制，每周两节德育课，加强对学生的关爱。中、英、数及通识教育四科按学生的水平分组教学，以照顾不同需要的学生。每年安排全方位学习活动日及中六境外考察，让学生扩阔视野及增加不同的学习经验。