中国科学院湿地研究中心是中国科学院下属的一个院级研究中心，成立于1995年，隶属于中国科学院东北地区地理与农业生态研究所。中心采用柔性联合的方式，汇集了来自中国科学院内部的不同研究所的研究力量，致力于湿地科学研究。

自20世纪60年代起，中国科学院长春地理研究所等单位就开始在全国范围内进行沼泽和泥炭资源的综合考察。到了90年代，随着中国科学院特别支持项目的实施，对全国沼泽进行了更深入的调查和研究。1995年，中国科学院湿地研究中心正式在长春地理研究所成立，随后联合了18个研究所和多个网络台站，形成了一个涵盖400余名科技人员的湿地研究团队。2002年，长春地理所合并了黑龙江农业现代化研究所，更名为中科院东北地理与农业生态研究所。2012年7月，湿地研究中心随同依托单位搬迁至新的办公地点——长春市高新北区盛北大街4888号湿地楼。

中国科学院湿地研究中心采取柔性联合的组织形式，由17个不同的研究所共同组成，拥有15名委员。中心设主任一名，由陈宜瑜担任，同时设有秘书长一职，由吕宪国负责。

湿地研究中心的主要研究领域包括湿地生态结构与生态过程、湿地环境效应、湿地编目及其资源动态变化、重要湿地生态环境评估和物种保护对策、湿地生物多样性和湿地分类系统等。此外，中心还关注湿地保护与可持续利用的优化模式，并在此基础上完成了多项高水平的科研成果。

湿地研究中心的主要任务是联合中国科学院内的湿地研究力量，组织并申请重大科研课题；开展湿地基础理论研究，构建中国的湿地科学体系；收集国内外湿地研究信息，建立湿地数据库；研究湿地资源开发、经济发展战略、生态环境及重大工程问题，提出相应的对策建议；建立不同区域湿地的合理开发和持续发展模式，为政府决策提供科学依据。中心还注重人才培养，通过合作研究和学术交流活动，培养了一批跨世纪的青年学者和学术带头人。同时，中心积极参与国际湿地研究合作，成为具有影响力的国际研究机构。