高能加速器研究机构（High Energy Accelerator Research Organization，简称 KEK）是由日本文部省成立的国家实验室，后经2004年法人化，隶属于日本大学共同利用机关法人。该机构致力于高能物理学与加速器科学的研究，同时也是综合研究大学院大学的一部分。

日本高能物理研究所KEK（National Laboratory for High Energy Physics）成立于1971年，最初是日本文部省的国家实验室，专注于高能物理、核物理和加速器技术的研究。1997年4月1日，KEK与东京大学原子核科学研究所INS（Institute for Nuclear Study）和东京大学理学院附属的介子科学实验室MSL（Muon Science Laboratory）合并，形成了高能加速器研究机构（High Energy Accelerator Research Organization），并保持了原有的英文缩写KEK。此次重组旨在整合资源，促进各领域研究者之间的紧密合作，以增强国际竞争力。重组后，KEK设立了粒子物理与核物理研究所以及材料科学研究所，后者的目标是利用多种先进的束流，如同步辐射光、中子、介子，进行多学科研究，涵盖物理学、化学、生物学、医学和农业科学，尤其是材料科学的前沿领域。支撑这些研究的大科学装置包括同步辐射装置-光子工厂（PF）、脉冲散裂中子装置（KENS）和强介子束装置等。

高能加速器研究机构的组织架构包括四个主要单位：基本粒子原子核研究所、物质结构科学研究所、加速器研究设施和共通基础研究设施。其中，加速器研究设施是KEK研究活动的核心，而共通基础研究设施则为研究活动提供辅助设施。

小林诚，曾任高能物理研究所教授、基本粒子原子核研究所所长，后来担任高能加速器研究机构理事、名誉教授（2009年1月晋升为特别荣誉教授），他在KEK的数据支持下，因其在贝尔实验方面的贡献，荣获2008年诺贝尔物理学奖。