菌苗是一种用于增强人体对特定传染病抵抗力的人工制品，通常由已灭活或削弱毒力的微生物组成。

活菌苗是由经过处理但仍具有免疫原性的细菌制成，这些细菌虽然已经失去致病能力，但在体内仍然能够生长繁殖。常见的活菌苗包括预防结核病的卡介苗（BCG）和鼠疫活菌苗。这类菌苗的优点是只需要接种一次，且产生的免疫效果持久，同时还能引发局部免疫。然而，活菌苗的保存需要特殊的冷藏条件，且有效期相对较短。

死菌苗是通过化学或物理手段使病原菌失活后，依然保留免疫原性的菌苗。常用的死菌苗有霍乱、伤寒、副伤寒甲、乙混合菌苗、百日咳菌苗等。由于病原菌已经被杀死，无法继续繁殖，所以死菌苗的使用剂量相对较大。为了提高免疫效果，常常需要多次接种。目前，人们尝试将多种死菌苗混合，形成联合菌苗，如伤寒菌、甲、乙型副伤寒菌混合的三联菌苗，以减少接种次数。