南秦水库是一座以防洪为主，兼顾灌溉、发电、养殖综合利用的水利枢纽工程。位于丹江一级支流的南秦河上游，总库容900多万立方米，最大支流金陵寺河。

2008年被列入国家病险水库除险加固项目，也是我市重点大中型水库除险加固项目之一，于2009年5月开工建设。

加固后的南秦水库防洪标准为50年一遇，校核标准达到了500年一遇。该工程的顺利实施，为南秦水库作为商洛市市区第二水源地和生态用水水源地提供了优先发展条件，也为下游6.3万群众、1.3万亩耕地及203省道、宁西铁路、上海—西安高速公路安全提供了有效保障。