中国水产科学研究院淡水渔业研究中心是中国农业部下属的一个综合性淡水渔业研究机构，成立于1978年，由太湖水产增殖科学实验基地和亚太地区综合养鱼研究和培训中心合并而成。1984年更名为现名。2002年11月，中心被认定为非营利性科研机构，纳入国家科技创新体系。中心主要研究领域涵盖淡水产养殖基础生物学和遗传育种、渔业生物多样性保护和种质资源保存、渔业水域生态环境检测与保护、渔业资源调查评估与管理、渔业重大病害灾变预警与控制、水产养殖容量与健康养殖、水产养殖对象营养学、渔业经济与信息技术等。中心设有7个研究室、4个实验基地，并与南京农业大学共建“南京农业大学无锡渔业学院”。中心拥有一支专业的科研队伍，包括博士生导师和硕士生导师。此外，中心还参与了多项国际合作项目，与多个国家和地区的科研机构开展了广泛的合作。

- 1978年，太湖水产增殖科学实验基地和亚太地区综合养鱼研究和培训中心在无锡建立，后合并成为一体，曾使用过“国家水产总局长江水产研究所”、“中国水产科学研究院长江水产研究所”等名称。

- 1981年起，机构开始承担国家援外技术和官员培训项目。

- 1984年，正式更名为中国水产科学研究院淡水渔业研究中心。

- 中心自“八五”期间起，连续被评为“全国农业科研综合实力百强研究所”。

- 1993年，中心与南京农业大学共同成立了“南京农业大学无锡渔业学院”。

- 2002年11月，中心被确认为非营利性科研机构，加入国家科技创新体系。

- 2003年，中国水产科学研究院淡水渔业研究中心水产博士后流动站成立。

- 2011年，南京农业大学无锡渔业学院开始招收国际留学生；同年11月，“中国水产科学研究院研究生中心”揭牌成立。

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心设有7个研究室和4个实验基地。同时，中心拥有1个农业部重点实验室、1个农业部风险评估实验室、4个农业部野外台站、1个农业部试验机构、2个农业部育种中心、1个中国水产科学研究院重点实验室、1个中国水产科学研究院工程技术研究中心、1个江苏省良种场，以及农业部新渔药临床中心指定单位。具体包括：

- 农业部重点实验室：农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

- 农业部风险评估实验室：农业部水产品质量安全环境因子风险评估实验室（无锡）

- 农业部野外台站：农业部长江下游渔业资源监测站、农业部长江下游渔业生态环境监测中心、农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站、农业部水产动物营养与饲料科学观测试验站

- 农业部试验机构：农业部饲料和饲料添加剂有效性试验机构

- 农业部育种中心：农业部长江流域鱼类遗传育种中心、农业部罗非鱼遗传育种中心

- 中国水产科学研究院重点实验室：中国水产科学研究院长江中下游平原渔业生态环境评价与资源养护重点实验室

- 中国水产科学研究院工程技术研究中心：中国水产科学研究院长江特色鱼类工程技术研究中心

- 江苏省良种场：江苏省省级对虾良种场

- 中心研究室：生物技术研究室、渔业环境保护研究室、大水面增养殖研究室、水产养殖研究室、水产病害与饲料研究室、渔业经济和信息研究室、水产遗传育种研究室

- 中心实验基地：南泉实验基地、屺亭实验基地、大浦实验基地、扬中实验基地

中心现有在职职工209人，其中包括高级专业技术人员65人。中心拥有博士生导师6人、硕士生导师30人。中心内有多位专家获得国家及省部级荣誉称号，如国家及省部级突贡专家3人，享受政府特殊津贴专家13人。此外，中心还有多个创新团队和首席科学家，包括“农业科研杰出人才及其创新团队”3个，国家产业技术体系首席科学家2人、岗位科学家6人，中国水产科学研究院首席科学家4人。

中心图书馆收藏有中外文图书、期刊共计3万余册，并提供渔业科学数据库服务。

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心在淡水水产生物技术和遗传育种、渔业资源和环境、淡水增养殖、水产病害与饲料等领域取得了显著研究成果。中心承担并完成了超过1500项国家和省部级研究课题，获得了196项科研奖励成果，其中包括国家级奖励9项、省部级奖励63项。中心培育了6个国家级水产养殖新品种，并发表了2691篇学术论文，出版了118部专著，获得了278项国家专利授权。

中心主办的《科学养鱼》杂志多次获得全国优秀水产报刊奖项，并入选为中文核心期刊。该杂志还获得了“第三届国家期刊奖百种重点期刊”奖等多项荣誉。

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心拥有1个博士后科研流动站、1个学术学位一级学科博士点、1个学术学位二级学科博士点、2个学术学位二级学科硕士点、1个专业学位领域硕士学位点。具体包括：

- 博士后科研流动站：水产养殖博士后科研流动站

- 学术学位一级学科博士点：水产学

- 学术学位二级学科博士点：水生生物学

- 学术学位二级学科硕士点：水产养殖、水生生物学

- 专业学位领域硕士学位点：农业推广渔业领域

中心与南京农业大学共同创办了“南京农业大学无锡渔业学院”，开设有全日制水产养殖学本科专业，并提供了多种成人高等教育专业选择。至今，中心已经培养了60多名博士、400多名硕士和1300多名本、专科毕业生。

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心积极参与国际交流合作，派遣科技人员前往40多个国家和地区进行交流访问和合作研究。中心与20多个国际组织、知名渔业研究机构及大学建立了合作关系，并设立了多个国际科技合作平台。此外，中心的亚太地区综合养鱼研究和培训中心为全球120多个国家和地区培训了2300多名水产技术和管理人才。

中心的标识设计体现了中心的工作性质和特点，标识中央为红色的英文缩写“FFRC”，上方为三只艺术化的鱼形象，下方则是一条象征江河湖海的波浪形线条。

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心积极组织和参加各种文化活动，包括义务献血、主题团日活动、遵规守纪知识竞赛、青少年科普活动、青年学术交流会、户外拓展训练、青年足球友谊赛等活动，旨在丰富员工的文化生活和社会责任感。