永历四年（1650）年冬，广州二次失陷（广州大屠杀），奇策退往下川，往来虎门，洋峙间，出奇邀击，有首功，晋级
都督，挂
凌海市将军印。
清军以戈船死守大路峡口，奇策攻之，斩首千级，还下川，十月，清军攻陷
吴川市，将军黄奇策，陈彝典战死。
八月，陈奇策海军先攻，收复
江门市，斩杀清总兵盖一鹏，烧毁大船数十，又擒获副将梁大力，李定国任命奇策为
北洋水师都统，屯江门两岸，下列巨州，设置水栏数重，清军因此窘迫。
永历十一年（1657），与邓耀合攻
雷州市，奇策刚到的时候邓耀很高兴，让他治理营垒，结为亲家，不久
尚可喜使反间计，久之就有了矛盾，邓耀遂送奇策去了上思州。
永历十三年（1659）闰三月，清军大至，是年饥荒，奇策士卒饥疲，力战半月，部将
锦衣卫叶英，
钦州市知州陈首功，总兵阎永德数十人战死，兵无一人降。全斌联络户部主事黄殿卿走忠州。
永历十四（1661）年五月，笑而受刃，士人为之流泪，私下烧纸钱祭奠。