置疑小檗为落叶灌木，高1-3米。老枝灰黑色，稍具棱槽和黑色疣点，幼枝紫红色，有光泽，明显具棱槽；
茎刺单生或三分叉，长7-20毫米，与枝同色。叶纸质，狭倒卵形，长1.5-3厘米，宽5-18毫米，先端近渐尖，基部渐狭，上面深绿色，中脉和侧脉隆起，背面淡黄色，中脉和侧脉明显隆起，两面网脉显著隆起，无毛，也无白粉，叶缘平展，每边具6-14细刺齿；叶柄长1-3毫米。
总状花序由5-10朵花组成，长1-3厘米，总梗长0.5-1厘米；
花梗长3-6毫米，细弱，无毛；花黄色；小苞片
披针形，长约1.5毫米，宽约1毫米，先端急尖；萼片2轮，外萼片卵形，长约2.5毫米，宽约1.5毫米，内萼片阔倒卵形，长约4.5毫米，宽约3.5毫米。
花瓣椭圆形，长约3.5毫米，短于内萼片，先端浅缺裂，基部楔形，具2枚腺体；
雄蕊长约2.5毫米，药隔延伸，先端短突尖；胚珠2枚。
浆果倒卵状椭圆形，红色，长约8毫米，直径约4毫米，顶端不具宿存花柱，不被白粉。花期5-6月，果期8-9月。