1990年，河源站定编为一个
四等站，并于1993年开通客运业务，2006年，河源站提高车站等级，升级为
二等站。2019年，河源站开通首趟
广州市、
深圳市城际列车。2020年，6月20日，河源站与中国全国同步实施
普速铁路电子客票。
2019年7月10日，
河源市火车站新增始发两对直达特快列车，据悉，这是河源第一次开行始发城际列车。分别为：广州东—河源的Z8001/4次、深圳—河源的Z8006/5次两对列车。
河源站站址在
广东省源城区，离北京西站2177公里，离深圳站195公里，离广州东站220公里。