河南省文物考古研究院成立于1952年，是中原地区最早的文物考古研究院所之一，承担着河南省地下文物的调查、发掘、保护和科学研究等任务。1981年2月成立河南省文物研究所，1994年12月又更名为河南省文物考古研究所，2013年4月更名为河南省文物考古研究院。

事业编制117人，其中专业技术人才68人。

全院设有13个科室：行政（党务）办公室、业务办公室、计财科、保卫科、史前时代考古研究室、夏商周考古研究室、汉唐宋考古研究室、科技考古研究室、技术室、文物科技保护中心、资料信息中心、公共考古与文化遗产保护中心、《华夏考古》编辑部。还设有郑州工作站、新郑工作站、郑州西山工作站、登封工作站等长期工作站点。

2022年7月，获得“全国文物系统先进集体”称号。